کنگره بین المللی زیست فناوری گیاهان دارویی و قارچ های کوهی

صفحه اصلی / پنجمین کنگره بین المللی و ششمین همایش ملی زیست فناوری گیاهان دارویی و قارچ های کوهی

Deep Learning and Multi-Omics Integration for Plant Secondary Metabolic Pathway Prediction

نویسندگان :

Zahra Sadeghi¹

1- دانشگاه سراوان

کلمات کلیدی :

Bioinformatics،Metabolomics،Natural Product Discovery،Pathway Engineering

چکیده :

Phytochemical pathway discovery is challenged by the complexity of plant metabolic networks, hindering the development of new natural products. To address this, we comprehensively reviewed databases like PubMed, Google Scholar, and Scopus to examine computational frameworks that integrate deep learning with multi-omics data. The results identified three primary strategies for data integration. Early integration combines all data into a single matrix, which is effective for straightforward prediction but can be challenged by high dimensionality. Intermediate integration seeks a shared, lower-dimensional representation of the data, making it a powerful tool for biological discovery by revealing latent relationships. Late integration analyzes each data type separately before merging the results, a method particularly useful in clinical applications where interpretability is crucial. While these approaches offer a more holistic understanding, they face challenges such as high data dimensionality and heterogeneity, with the most effective strategy ultimately depending on the specific research objective.

لیست مقالات

لیست مقالات بایگانی شده

نقش کلیدی متابولیت‌های ثانویه در بهبود تحمل به فلزات سنگین در گیاهان تلقیح‌شده با قارچ‌های همزیست

محمدرضا جلالی - مینا امانی

Isolation, sequencing and bioinformatics studies of the promoter of germacrine D synthase gene in basil

Fatemeh Khakdan - Sargol Gohari

Isolation and molecular identification of endophytic bacteria from Nepeta crispa

Farnoosh Rasoul sharifi - Reza Habibipoor - Mohsen Rajabi - Melika Esfandiari

Evaluation of antioxidant and antimicrobial activities of Echium italicum L. extracts, (leaf, flower, stem and seed)

Zahra Dashtizadeh - Abdoarrasoul Haghir Ebrahimabadi - Azam Monfared - Ahmad Mirshokraei - Samaneh Heydari

Comparative Analysis of Phenolic Profiles and Biological Activities in Three Lamiaceae Species (Rosmarinus officinalis L., Mentha piperita L. and Ocimum basilicum L.) Using HPLC and HPTLC

Parisa Hamzehali - Reihaneh Khosravi - Sima Najafi - Khalil Farhadi - Mohsen Farhadpur

Carbon nanotubes: A promising nanocarrier for gene transfer to plant cells

Sara Abedini - Shahram Pourseyedi - Jafar Zolala - Roohollah Abdolshahia

بررسی اثر عصاره گیاهان جینسینگ، سرخارگل، گل بنفشه و زنجبیل بر روی قارچ آسپرژیلوس فلاووس در شرایط آزمایشگاهی و مدل حیوانی

سیما صحرایی - مجتبی محمدی رکن آبادی - رسول شکری

Evaluation of antioxidant effect and antimicrobial activities of various extract of Rhus coriaria L.

Samaneh Heydari - Abdolrasoul Haghir-e-ebrahimabady - Azam Monfared - Sayed Ahmad Mirshokraei - Zahra Dashtizadeh

Effect of harvest time on phytochemical characteristics of Momordica charantia

Zeynab Mohkami - Azizollah Kheiry - Mohsen Sanikhani

بررسی تنوع ژنتیکی در برخی از ژنوتیپ های جنس کاسنی (Cichorium spp.) با استفاده از نشانگرهای مولکولی ISSR

نیلوفر علی پور - احسان شهبازی - فریبا رفیعی

بیشتر

ثمین همایش، سامانه مدیریت کنفرانس ها و جشنواره ها - نگارش 42.4.5